Am 5. September 1624 wird der Neubau des Klostergebäudes in heutiger Form eingeweiht. Das Gebäude entsteht unter Abt Johannes Dressel (1618–1634) mit seinen Ecktürmen, dem reich verzierten Steinportal und dem imposanten Renaissancegiebel. Der Erbauer bleibt anonym. Das prachtvolle Gebäude prägt auch heute noch das Mainstockheimer Ortsbild.
Die Plünderungen durch die Schweden im Dreißigjährigen Krieg übersteht der prächtige Ebracher Amtshof ab 1631 recht unbeschade